A Jakabffy Elemér Alapítvány 2002 decemberében hozta létre Kortörténeti Gyűjteményét. A Kortörténeti Gyűjtemény célja egyrészt a romániai magyarság történetére, különösen a rendszerváltás utáni időszakra vonatkozó információk gyűjtése, kutathatóvá tétele és közzététele. Másrészt, a JEAKGy célja a kolozsvári magyar társadalomtudományi kutatás és képzés (különösen a politológia és a jelenkor története) dokumentációs hátterének megteremtése rendszeres kutatási munkamegbeszélések, előadások és továbbképzések szervezésével, valamint kézirattárának, hanganyag gyűjteményének (interjúk), dokumentumfilm gyűjteményének, folyóirat-gyűjteményének és társadalomtudományi kézikönyvtárának folyamatos bővítése és kutathatóvá tétele által.
Az alapítvány névadója, Jakabffy Elemér (Lugos, 1881. május 17. – Szatmárnémeti, 1963. május 19.) magyarországi, majd az impériumváltás után romániai magyar politikus, jogász és publicista, akit intenzíven foglalkoztatott a nemzetiségi kérdés. 1938-ban a Magyar Tudományos Akadémia külső tagjává választották. 1944-ben nemzetiségi túszként internálták Bukarestbe, ahol nyolc hónapot töltött, majd Hátszeget jelölték ki új lakhelyéül. Hátszegi kényszertartózkodásának csak 1954-ben lett vége. 1957-ben a fiához költözött Szatmárnémetibe, ahol visszavonultan élt.
Az úgynevezett “kéziratgyűjtemény” nem csak kéziratokat, hanem más típusú dokumentációt is tartalmaz. 1) A Budapesten működő volt Magyarságkutató Intézet Gyűjteményéből, illetve a Szegedi Társadalomtudományi Egyetem Gyűjteményéből származó anyagok, amelyek a hetvenes években készültek a romániai magyar kisebbségről. Míg a szegedi anyagok zöme Magyarországon íródott, a budapesti anyagok jelentős része Erdélyben készült, amelyet a romániai politikai rendőrség elől Magyarországra csempésztek. Ezek a romániai magyarság helyzetével kapcsolatos jogi és szociológiai megközelítésű elemzéseket és dokumentumokat Romániában nem lehetett publikálni, ezért diplomáciai futárral Magyarországra menekítették őket. Jelenleg Magyarországon nincsen a romániai magyarok történetével foglalkozó, aktívan gyarapított dokumentumtár, így a releváns anyagok jórésze a JEAKGY-ba kerül. 2) A romániai magyarokkal, illetve a Romániai Magyar Demokrata Szövetséggel kapcsolatos források és kutatási jelentések. 3) Levéltári dokumentumok fénymásolata, amelyet a Tismăneanu-bizottság (A Romániai Kommunista Diktatúra Elemzésével Foglalkozó Elnöki Bizottság) magyar kutatócsoportja gyűjtött 2006-ban a magyar kisebbséggel kapcsolatosan. 4) Magyar értelmiségiek Szekuritáté-dossziéinak másolata. 5) Különböző típusú hagyatékanyagok, közöttük kéziratok is, amelyeket nem lehetett publikálni az államszocializmus idején.
A JEAKGY további tevékenységét az Adatbank – Erdélyi Magyar Elektronikus Könyvtár tartalomfejlesztését szolgáló szakmai irányítás, valamint digitalizált anyagok szolgáltatása képezi (http://www.adatbank.ro/). A digitalizálás és az anyagok közzététele a platformon keresztül a JEAKGY tartalomfejlesztési politikájának egyik alappillérét képezi. A hosszútávú cél egy átfogó képet nyújtani a romániai magyar társadalomról és kulturális örökségről, amibe értelemszerűen beletartozik az államszocialista korszak is.
Az alapgyűjteményt két történész, Bárdi Nándor és Vincze Gábor hozta létre. Az Alapítványnak nincsenek fizetett alkalmazottai sem a kutatói, sem a szervezői, adminisztratív munkákra. A könyvtárat egyetemi hallgatók működtetik, a beérkező anyagokat többnyire a hallgatók dolgozzák fel, a szakmai irányításért Bárdi Nándor és Lőrincz D. József kutatók a felelősök, míg a szervezet működését Györgyjakab Izabella kutató, és az Alapítvány elnöke, Székely István biztosítja.